بروتينات رابطة للرنا
المظهر
البروتينات الرابطة للرنا (غالباً ما يتم اختصارها بRBPs) هي البروتينات التي تربط الحمض النووي الريبوزي المزدوج أو أحادي الخُيَيْطْ[1] مع الخلايا، وتشارك في تشكيل مركبات البروتين النووي، تحتوي RBPs على أشكال بنيوية مختلفة، مثل عزم التعرف على RNA (RRM)، ومجال ربط dsRNA، وإصبع الزنك (zinc finger) وغيرها.[2] وهي بروتينات سيتوبلازمية ونووية. ومع ذلك، فبما أن معظم الحمض النووي الريبوزي الناضج يتم تصديره من النواة بسرعة نسبيا، فإن معظم الـ RBPs في النواة توجد كمركبات بروتينية وpre-mRNA تسمى جزيئات بروتينات الدم غير المتجانسة (hnRNPs).[3]
انظر أيضا
[عدل]وصلات خارجية
[عدل]- starBase platform: a platform for decoding binding sites of RNA binding proteins (RBPs) from large-scale CLIP-Seq (HITS-CLIP, PAR-CLIP, iCLIP, CLASH) datasets.
- RBPDB database: a database of RNA binding proteins.
- ATtRACt database: a database of RNA binding proteins and associated motifs.
- SplicedAid-F: a database of hand -cureted human RNA binding proteins database.
- RsiteDB: RNA binding site database
- dRNA-seq[وصلة مكسورة]: Template-based prediction of RNA binding proteins and their complex structures.
- dRNA-3D[وصلة مكسورة]: RNA binding proteins prediction from 3D structures.
- ENCODE Project: A collection of genomic datasets (i.e. RNA Bind-n-seq, eCLIP, RBP targeted shRNA RNA-seq) for RBPs
- RBP Image Database: Images showing the cellular localization of RBPs in cells
المراجع
[عدل]- ^ RNA-Binding+Proteins في المكتبة الوطنية الأمريكية للطب نظام فهرسة المواضيع الطبية (MeSH).
- ^ Lunde، B. M.؛ Moore، C؛ Varani، G (2007). "RNA-binding proteins: Modular design for efficient function". Nature Reviews Molecular Cell Biology. ج. 8 ع. 6: 479–90. DOI:10.1038/nrm2178. PMID:17473849.
- ^ Hogan، Daniel J.؛ Riordan، Daniel P.؛ Herschlag، Daniel؛ Brown، Patrick O.؛ Brown، Patrick O. (2008). "Diverse RNA-Binding Proteins Interact with Functionally Related Sets of RNAs, Suggesting an Extensive Regulatory System". PLOS Biology. المكتبة العامة للعلوم. ج. 6 ع. 10: e255. DOI:10.1371/journal.pbio.0060255. PMC:2573929. PMID:18959479.
{{استشهاد بدورية محكمة}}
: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)